한나라당 대선 경선 후보인 이명박 전 서울시장 측은 경찰이 서울시정연구원을 압수수색한 것과 관련 "정권차원의 대운하 보고서 조작 의혹에 대한 전형적인 물타기 수사"로 규정하고 "이명박 후보는 지시하거나 관계한 일도 전혀 없다"고 맹비난했다.
이 후보 측 진수희 대변인은 이날 논평을 통해 "(한반도운하 관련) 시정연구원 연구는 독자적 판단에 따른 것이었음이 관련 공문서 등에 의해 확인됐다"면서 이같이 말했다.
진 대변인은 "(한반도대운하 관련 보고서는) 시정연구원 자체 의결에 따라 물류체계 경쟁력 강화를 위해 연구를 시행한 것"이라며 "연구항목도 수도권 물류 경쟁력 제고를 위해 도로, 철도, 지하철, 한강 페리, 항공, 수운 등 전 분야에 걸쳐 있고 경부운하는 여러 연구대상 중 하나"라고 강조했다.
진 대변인은 "선관위 조사과정에서 17쪽 짜리 보고서가 또 발견되는 등 보고서의 위.변조 의혹이 최고조에 이른 시점에서 경찰이 압수수색에 나선 것은 또 하나의 '이명박 죽이기'"이라며 "노무현 정권은 '대운하와 이명박 죽이기' 공작의 실체를 고백하고 정권 연장의 미련을 버려야 한다"고 주장했다.
그는 이어 "도대체 이명박 죽이기 보고서를 몇 개나 만들었나"라면서 "청와대에 보고했다는 9쪽 짜리 보고서, 언론과 정치권에 유출된 TF팀 명의의 37쪽 짜리 위.변조 보고서, 수자원기획관실 명의의 37쪽 짜리 보고서, 이번에 등장한 17쪽 짜리 선관위 적발 보고서까지 벌써 나온 것만 해도 네 종류"라고 덧붙였다.